Efter fire år i eksil hentes Justin March hjem til RUNA, Republic of United America, for at hjælpe med at opklare en række mystiske mord. Elitesoldaten, Mae Koskinen, er sat til at passe på Justin, men det er ikke nemt at passe på en mand der ikke passer på sig selv. I starten af det 21. århundrede blev halvdelen af jordens befolkning dræbt af Mefistofeles-virussen, inden det lykkedes at finde en vaccine. Nu er RUNA dannet af Canada og dele af Nordamerika, det mest stabile land i verden. Age of X er en futuristisk krimiserie med overnaturlige elementer.