Sandra på 13, Anton på 12 og Fanny på 11 bor på øen Kylholm, der ligger tæt på Samsø. Det er her skibene lægger til, hvis de skal i karantæne, og det er børnenes far, kommandanten, der bestemmer over det hele.

Der bor ikke så mange mennesker på øen, som de tre børn kender ud og ind. Så da de en dag finde en fremmed dreng i deres hemmelige hule, er de meget nysgerrige for at finde ud af, hvor i alverden han kommer fra...? Gudrun Eriksen (1894-1967) var en dansk forfatter og dansklærer. Hun boede i Roskilde, hvor hun også underviste ved Sankt Josef Skolen. Gudrun Eriksens fascination af lokalhistorie mærkes tydligt i bogserierne om "Kommandantens børn" og "Nyboder-bøgerne", hvor Københavns historie har en afgørende betydning for handlingen. Gudrun Eriksen færdiggjorde tredje og sidste del af den berømte serie om pigen Tudemarie, da forfatter Maria Andersen døde.